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自由能计算(FEP/TI)实践笔记

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结合自由能计算的价值取决于结果的可信度与可解释性。本笔记把产线项目中反复出现的决策点——扰动路径设计、λ 窗口数量分配、软核势参数与收敛判据——整理成一套可迁移的操作惯例。

笔记第一章先给出一套「先跑通再跑准」的分阶段流程:从快速 RBFE 校验到完整 ABFE 交付,每一阶段都有明确的进入与退出条件。

第三章复盘了 8 个真实项目的误差分解:哪些误差来自采样不足,哪些来自扰动设计,哪些来自体系制备,并给出对应的改进动作。

完整内容付费解锁 · 5 章 · 24 页
目录 CONTENTS
  1. 第一章 分阶段计算流程
  2. 第二章 扰动设计与 λ 窗口分配
  3. 第三章 8 个项目复盘与误差分解
  4. 第四章 收敛判据与结果报告模板
  5. 第五章 常见报错与处理记录

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